Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Trappc6bQ9D289 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Trappc6bQ9D289 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Trappc6bQ9D289 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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