Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Syf2Q9D198 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms