Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem53Q9D0Z3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1617.4 ms