Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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