Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
CenpnQ9CZW2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CenpnQ9CZW2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms