Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrs1Q9CYH6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms