Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nip7Q9CXK8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nip7Q9CXK8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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