Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sgo1Q9CXH7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sgo1Q9CXH7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sgo1Q9CXH7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sgo1Q9CXH7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgo1Q9CXH7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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