Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Pin4Q9CWW6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Pin4Q9CWW6 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pin4Q9CWW6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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