Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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MINDY3Q9CV28 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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MINDY3Q9CV28 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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MINDY3Q9CV28 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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MINDY3Q9CV28 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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MINDY3Q9CV28 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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MINDY3Q9CV28 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MINDY3Q9CV28 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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MINDY3Q9CV28 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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MINDY3Q9CV28 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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MINDY3Q9CV28 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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MINDY3Q9CV28 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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MINDY3Q9CV28 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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MINDY3Q9CV28 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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MINDY3Q9CV28 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MINDY3Q9CV28 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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