Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms