Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcf1Q9CTH6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms