Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms