Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ykt6Q9CQW1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms