Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms