Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
GpnmbQ99P91 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms