Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Mrpl43Q99N89 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl43Q99N89 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl43Q99N89 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl43Q99N89 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl43Q99N89 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl43Q99N89 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl43Q99N89 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl43Q99N89 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl43Q99N89 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl43Q99N89 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl43Q99N89 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Mrpl43Q99N89 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms