Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hdac9Q99N13 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hdac9Q99N13 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hdac9Q99N13 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hdac9Q99N13 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hdac9Q99N13 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hdac9Q99N13 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hdac9Q99N13 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hdac9Q99N13 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hdac9Q99N13 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hdac9Q99N13 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hdac9Q99N13 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hdac9Q99N13 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hdac9Q99N13 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac9Q99N13 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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