Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PccbQ99MN9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms