Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp1b4Q99ME6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms