Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprtQ99M80 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprtQ99M80 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms