Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gdpd3Q99LY2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms