Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms