Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Smim11aQ99J19 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Smim11aQ99J19 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Smim11aQ99J19 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Smim11aQ99J19 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Smim11aQ99J19 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Smim11aQ99J19 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim11aQ99J19 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
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