Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ctu1Q99J10 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ctu1Q99J10 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ctu1Q99J10 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ctu1Q99J10 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ctu1Q99J10 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ctu1Q99J10 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ctu1Q99J10 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ctu1Q99J10 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ctu1Q99J10 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ctu1Q99J10 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ctu1Q99J10 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ctu1Q99J10 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ctu1Q99J10 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctu1Q99J10 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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