Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Creb3l3Q91XE9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Creb3l3Q91XE9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Creb3l3Q91XE9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Creb3l3Q91XE9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Creb3l3Q91XE9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Creb3l3Q91XE9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Creb3l3Q91XE9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms