Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms