Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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