Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Top1mtQ8R4U6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top1mtQ8R4U6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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