Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lin28aQ8K3Y3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lin28aQ8K3Y3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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