Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ssh3Q8K330 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ssh3Q8K330 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ssh3Q8K330 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ssh3Q8K330 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ssh3Q8K330 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ssh3Q8K330 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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