Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Abcf3Q8K268 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Abcf3Q8K268 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Abcf3Q8K268 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms