Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrit1Q8K099 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms