Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Znf628Q8CJ78 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms