Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trip10Q8CJ53 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trip10Q8CJ53 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms