Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cdc34Q8CFI2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms