Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ercc8Q8CFD5 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ercc8Q8CFD5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ercc8Q8CFD5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ercc8Q8CFD5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ercc8Q8CFD5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ercc8Q8CFD5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ercc8Q8CFD5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ercc8Q8CFD5 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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