Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc17Q8CE13 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc17Q8CE13 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc17Q8CE13 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccdc17Q8CE13 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc17Q8CE13 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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