Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc38Q8CDN8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc38Q8CDN8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc38Q8CDN8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc38Q8CDN8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc38Q8CDN8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc38Q8CDN8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc38Q8CDN8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc38Q8CDN8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc38Q8CDN8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc38Q8CDN8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc38Q8CDN8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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