Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Nhlrc3Q8CCH2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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