Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z3

Ssxb2, Synovial sarcoma, X member B2, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb2Q8C5Z3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssxb2Q8C5Z3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb2Q8C5Z3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb2Q8C5Z3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb2Q8C5Z3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb2Q8C5Z3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb2Q8C5Z3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb2Q8C5Z3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb2Q8C5Z3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssxb2Q8C5Z3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb2Q8C5Z3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb2Q8C5Z3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb2Q8C5Z3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb2Q8C5Z3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb2Q8C5Z3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb2Q8C5Z3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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