Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms