Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8C5C9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms