Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Usp44Q8C2S0 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp44Q8C2S0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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