Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usp37Q8C0R0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usp37Q8C0R0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usp37Q8C0R0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usp37Q8C0R0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp37Q8C0R0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms