Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ctdsp2Q8BX07 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ctdsp2Q8BX07 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ctdsp2Q8BX07 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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