Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Usp38Q8BW70 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp38Q8BW70 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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