Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ttc12Q8BW49 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ttc12Q8BW49 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ttc12Q8BW49 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ttc12Q8BW49 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ttc12Q8BW49 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ttc12Q8BW49 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ttc12Q8BW49 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc12Q8BW49 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc12Q8BW49 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc12Q8BW49 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc12Q8BW49 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc12Q8BW49 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc12Q8BW49 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc12Q8BW49 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ttc12Q8BW49 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ttc12Q8BW49 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc12Q8BW49 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms