Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atg4dQ8BGV9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atg4dQ8BGV9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atg4dQ8BGV9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atg4dQ8BGV9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atg4dQ8BGV9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atg4dQ8BGV9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Atg4dQ8BGV9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Atg4dQ8BGV9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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