Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Atg4bQ8BGE6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms